Task #1101

Test de faisabilité

Added by Sylvain Derossi over 3 years ago. Updated over 3 years ago.

Status:NewStart date:06/03/2015
Priority:NormalDue date:06/03/2015
Assignee:-% Done:

100%

Category:-Estimated time:3.00 hours
Target version:-

Description

J'ai récupéré un stak Z and Time pour tester Imaris et son module de tracking, et également le module Cell.

module CELL

Il répond à la demande de Mounia pour notamment :
- segmentation des noyaux / utilisation du split object
- tracking des spots et mesure de leur variation d'intensité dans le temps
- fichier excel donnant accès aux intensity mean par spots in time
- ajustement de la taille des spots dans le temps (region growing)
- code de couleur qui permet de visualiser les cellules suivant le nombre de spots
- tracking des noyaux

module vantage

Permet une visualisation globale (tous les spots) de l'évolution d'intensité des spots.

Tracking int.xml Magnifier (103 KB) Sylvain Derossi, 06/05/2015 06:15 PM

Vantage_001.tif (593 KB) Sylvain Derossi, 06/05/2015 06:16 PM

History

#1 Updated by Sylvain Derossi over 3 years ago

  • Description updated (diff)

#2 Updated by Sylvain Derossi over 3 years ago

#3 Updated by Sylvain Derossi over 3 years ago

Also available in: Atom PDF